1988年度
任意団体として、村田氏を代表とした有志により佃FCが産声を上げました。
東京都中央区所属のサッカースポーツ少年団として登録し、選手保護者、OB指導者が団長としてのバトンを引き継ぎながら運営されました。
初代団長:村田 光政 氏
2代目団長:三浦 瑜鶴 氏
3代目団長:稲毛 一夫 氏
4代目団長:杉田 隆久 氏
5代目団長:山口 洋介 氏
6代目団長:筑間 博章 氏
7代目団長:齋藤 篤史 氏
2024年度
法人設立を有志で確認、NPO法人化の準備が始まりました。
2025年度
2月：佃FC保護者説明会を開催し、NPO設立準備委員会が立ち上がりました。
4月：NPO法人設立総会が開催されました。
9月：東京都より認証証を受け、9月30日付けで 特定非営利活動法人佃フットボールクラブ が法人登記完了となりました